Dans le cadre du master Bioinfo@Lyon les étudiants sont amenés à réaliser deux stages. La durée des stages est de deux mois pour le master 1 et de six mois pour le master 2. Ils permettent l'acquisition de 9 et 27 ECTs respectivement.

Les stages sont réalisés individuellement en entreprise ou au sein d'une structure de recherche privée ou publique.


Stage Data Science

Contact : Aurobacs

Courriel :   [email protected]

Structure : Aurobac therapeutics



Réseau de neurones convolutifs pour la segmentation de pieds astrocytaires observés en microscopie électronique 2D

Contact : Audrey Denizot et Anais Badoual

Courriel :   [email protected] ; [email protected]

Structure : INRIA



Mise en place d’un outil d’interopérabilité à l’aide d’une base de connaissance graphe

Contact : Célia Michotey et Nicolas Francillonne

Courriel : [email protected] et [email protected]

Structure : INRAE



Modélisation métabolique du pathosystème tomate/Ralstonia solanacearum sous contrainte azotée


Contact : Caroline Baroukh

Courriel : [email protected]

Structure : INRAE



Analyse de données de metaprotéomique

Contact : Julie Flecheux et Jérôme Lemoine

Courriel : [email protected] ; [email protected]

Structure : Institut des Sciences Analytiques 



Identification des interactions des effecteurs Bsp avec les protéines humaines

Contact : Emmanuel Bettler et Laurent Terradot

Courriel : [email protected] et [email protected]



Utilisation des méthodes de l'intelligence artificielle pour l'enrichissement des métadonnées biologiques, écologiques et géographiques associées à l'archive de séquences internationale SRA

Contact : Romuald Marin

Courriel : [email protected]

Structure : Pôle Rhône-Alpes de Bioinformatique (PRABI-AMSB)



Ingénieur en informatique

Contact : Anne Goelzer et Benjamin Linard

Courriel : [email protected]

Structure : MIAT, INRAE Toulouse



Modélisation spatiale de la diffusion du virus OsHV-1 : évaluation des risques épidémiologiques et valorisation via une interface web

Contact : Maude Jacquot

Courriel : [email protected]

Structure : IFREMER



Conception d'une base de données géoréférencée et partagée pour l'étude du risque sanitaire lié à l'aménagement de solutions fondées sur la nature en milieu urbain

Contact : Agnès Leblond

Courriel : [email protected]

Structure : VETAGROSUP



Traitement de données et visualisation interactive de données pour la science ouverte

Contact : Fabien Chauvreau

Courriel : [email protected]

Structure : Centre de Recherche en Neuroscience Lyon



Refining generative models for B-cells recombination and mutation

Contact : Quentin Marcou

Courriel : [email protected]

Structure : COMPO Inria Sophia Antipolis



Analysis of lung cancer neoantigens and infiltrated lymphocytes

Contact : Quentin Marcou

Courriel : [email protected]

Structure : COMPO Inria Sophia Antipolis



Analysis of neuron-glia communication using single-cell transcriptomics

Contact : Hugues Berry

Courriel : [email protected]

Structure : INRIA



Machine learning for microbiome

Contact : Zakaria Tougui

Courriel : [email protected]

Structure : Université de Grenoble




RER express - ruminant endogenous retrovirus expression

Contact : Emmanuel Lerat, Jocelyn Turpin

Courriel : [email protected] ; [email protected]

Structure : LBBE et IVPC Université Claude Bernard Lyon 1