Dans le cadre du master Bioinfo@Lyon les étudiants sont amenés à réaliser deux stages. La durée des stages est de deux mois pour le master 1 et de six mois pour le master 2. Ils permettent l'acquisition de 9 et 27 ECTs respectivement.

Les stages sont réalisés individuellement en entreprise ou au sein d'une structure de recherche privée ou publique.

OFFRE DE STAGE 2024/2025

RER express - ruminant endogenous retrovirus expression

Contact : Turpin Jocelyn

Courriel : jocelyn.turpin@univ-lyon1.fr

Structure : UCBLyon 1, LBBE (Villeurbanne) et IVPC (Gerland)

Offre de stage Master 2

Contact : Danion Morgane

Courriel : morgane.DANION@anses.fr

Structure : Unité VIMEP, Labo. PPN de l'Anses, Brest

Integrative multi-Omic analysis for priming potential in a model forest and cultivated tree species : poplar

Contact : Maury Stéphane

Courriel : stephane.maury@univ-orleans.fr

Structure :University Orleans, Lab P2e

Approche par graphes temporels pour l'étude de la dynamique et convergence des recherches sur les polluants organiques persistants et l'endométriose

Contact : MEIJE Mathé et FRAINAY Clément

Courriel : meije.mathe@inrae.fr et clement.frainay@inrae.fr

Structure : INRAE Toulouse, UMR 1331

Modélisation de réseaux métaboliques pour analyser l'impact de gènes régulateurs de p53 sur le métabolisme tumoral

Contact : STINGL Maximilian et POUPIN Nathalie

Courriel : maximilian.stingl@inrae.fr et nathalie.poupin@inrae.fr

Structure : INRAE Toxalim

Phylogenetic inference in recombinant sequences using hidden Markov models. Application to the study of gene conversion dynamics in paramecium

Contact : GUEGEN Laurent

Courriel : laurent.guegen@univ-lyon1.fr

Structure : UCBLyon 1, LBBE Villeurbanne

Caractérisation large échelle du virome des animaux, vecteurs et environnements réservoirs de pathogènes humains à partir des données de séquençage de l'archive internationale SRA

Contact : NAVRATIL Vincent

Courriel : vincent.navratil@univ-lyon1.fr

Structure : UCBLyon 1, PRABI-AMSB

Using demographic inference methods to reveal invisible speciation events

Contact : DE VIENNE Damien

Courriel : damien.de-vienne@univ-lyon1.fr

Structure : UCBL, LBBE

Construction d'un arbre phylogénétique de référence pour l'assignation de données de métabarcoding chez les métazoaires

Contact : LEFEBURE Tristan

Courriel : tristan.lefebure@univ-lyon1.fr

Structure : UCBLyon 1, LEHNA

Development of molecular tools (metabarcoding) for the study of soil actinobacteria, focusing on the genus Frankia

Contact : SHADE Ashley

Courriel : ashley.shade@cnrs.fr

Structure : UCBL, Laboratoire d'Ecologie Microbienne

Annonces de stages et alternances Biomérieux

Contact : Voir annonce en ligne

Courriel : Voir annonce en ligne

Structure : Entreprise Biomérieux - Marcy l'Etoile

Mise en place d’outils/pipelines pour l’analyse de données de pharmacogénétique

Contact : Claire Bardel

Courriel : claire.bardel@univ-lyon1.fr

Structure : HCL

Recherche de variants rares associés aux dyslipidémies

Contact : Claire Bardel et Corentin Molitor

Courriel : claire.bardel@univ-lyon1.fr et corentin.molitor@chu-lyon.fr

Structure : HCL

Recherche de liens entre la concentration en Lp(a) et des facteurs génétiques dans le cadre des dyslipidémies

Contact : Claire Bardel et Corentin Molitor

Courriel : claire.bardel@univ-lyon1.fr et corentin.molitor@chu-lyon.fr

Structure : HCL

Characterization of the genetic diversity of European dark bees following a recent territorial change in the Cevennes national park

Contact : Fréderic Austerlitz et Hélène Quach

Courriel : frederic.austerlitz@mnhn.fr et helene.quach@mnhn.fr

Structure : Musée de l'homme, Paris

Effets des microplastiques sur l'expression de gènes chez le moustique

Contact : Amandine Aviles

Courriel : amandine.aviles@umontpellier.fr

Structure : UMR MIVEGEC, Univ. Montpellier

Exploration du côté obscur du sequençage métagénomique dédié au diagnostic et à la recherche clinique

Contact : Laurence Josset

Courriel : laurence.josset@chu-lyon.fr

Structure : HCL GENEPII (Lyon, Croix Rousse)

Data Science intern

Contact : Inès Houngbadji

Courriel : jobs@aurobac-tx.com

Structure : Aurobac therapeutics

Etude du métabolisme de microorganismes extrêmophiles incultivés impliqués dans la production primaire de l'écosystème hydrothermal serpentinisé, de Prony (Nouvelle Calédonie) par approche métagénomique

Contact : Gael Erauso

Courriel : gael.erauso@mio.osupytheas.fr

Structure : Campus de Luminy, Institut Méditerranéen d'Océanologie

Définition d'un pipeline automatisé pour la détection des virus endogènes dans les génomes eucaryotes

Contact : Julien Varaldi

Courriel : julien.varaldi@univ-lyon1.fr

Structure : UCBL - LBBE - UMR5558

Numerical simulations of polluted cell membrane models under extreme conditions

Contact : Paulo Telles De Souza, Carlos Marques

Courriel : paulo.telles_de_souza@ens-lyon.fr;carlos-marques@ens-lyon.fr

Structure : ENS LYON

Transport of effector proteins

Contact : Juliette Martin

Courriel : juliette.martin@ens-lyon.fr

Structure : ENS LYON

Simulating the ubiquitination system

Contact : Riccardo Pellarin, Guillaume Launay

Courriel : riccardo.pellarin@ens-lyon.fr ; guillaume.launay@ens-lyon.fr

Structure : ENS LYON

In vitro toxicity of a mixture of air pollutants in a complex model of human respiratory cells

Contact :Sylvain Billet

Courriel : sylvain.billet@univ-littoral.fr

Structure : UR4492 - Maison de la Recherche en Environnement industriel

Développement d'outils et acquisition de connaissances sur la structure, l'évolution et le fonctionnement du génome

Contact : Nicolas Francillonne et Johann Confais

Courriel : nicolas.francillonne@inrae.fr ; johann.confais@inrae.fr

Structure : INRAE Versailles

Proposition de stage Master 2 en bioinformatique appliqué à l'immunologie

Contact : Magali Richard et Marc Dalod

Courriel : magali.richard@univ-grenoble-alpes.fr ; dalod@ciml.univ-mrs.fr

Structure : Labo. TIMC au CIML