Structure : Laboratoire d'Ecologie Alpine, Univ. Grenoble
Dans le cadre du master Bioinfo@Lyon les étudiants sont amenés à réaliser deux stages. La durée des stages est de deux mois pour
le master 1 et de six mois pour le master 2. Ils permettent l'acquisition de 9 et 27 ECTs respectivement.
Les stages sont réalisés individuellement en entreprise ou au sein d'une structure de recherche privée ou publique.
STAGE DE M2 - M1 2025/2026
The impact you - can have here
Développement et optimisation d'un pipeline de phylogénomique basé sur les UCEs pour une distribution au sein d'un consortium scientifique
Association entre modification chimiques des ARNr et composition de l'infiltrat immunitaire dans les cancers du sein triple-négatifs
Evolution de la microflore bactérienne musocale chez Magallana gigas au cours d'une infection par le virus OsHV-1
Contact : DELREZ Natacha, MORGA Benjamin
Courriel : [email protected] ; [email protected]
Structure : IFREMER
Mise en place d'un outil pour l'analyse de la diversité intra-hôte SARS-CoV-2
Reproductibilité des analyses dans des applications web interactives sous R (shiny)
Internship project : single-nuclei transcriptomic dynamics of postnatal skeletal muscle growth
Contact : JAGOT Sabrina, LE-GRAND Fabien
Courriel : [email protected] ; [email protected]
Structure : CNRS - INSERM U1217
Développement d'un outil d'analyse d'image pour la détection et la classification des globules rouges falciformes
Design and Benchmark of a tool for environmental detection of antibiotic resistance plasmids
Intégration de données métaprotéomiques et métagénomiques pour la compréhension du fonctionnement de consortia microbiens lignocellulolytiques
Contact : RAQUET HERNANDEZ G. et DEJEAN S.
Courriel : [email protected] ; [email protected]
Structure : Institut de Mathématiques de Toulouse
Etude de la biologie des ARN chez des plantes soumises à des stress abiotiques par des approches de séquençage basées sur des lectures longues
Contact : MOISSIARD Guillaume et PICAULT Nathalie
Courriel : [email protected] ; [email protected]
Structure : Université de Perpignan
Pangenome graph simplification strategies for the detection of structural variants
Contact : LEMAITRE Claire et URICARU Raluca
Courriel : [email protected] ; [email protected]
Structure : INRIA Rennes et Université de Bordeaux
Metagenomic analysis of glacier microbial communities for ice nucleation and cold adapation genes
Diversité, dynamique et activité des virus marins en Méditerranée : une approche multi-omique au sein du projet BIOSWOT-Med
Contact : BORDI Christophe
Courriel : [email protected]
Structure : Institut Méditerranéen d'Océanologie
Caractérisation de peptidomes de levure par spectrométrie de masse haute résolution
Integrative multi-Omic analysis for pea aphids
Modélisation de l'influence du microbiote intestinal sur le métabolisme de la drosophile
Intégration de données single-cell RNA-seq et multi-omiques pour étudier les effets de l'oléate alimentaire sur le tissu adipeux en contexte d'obésité (Oleatomics)
Contact : DUCHEIX Simon et BLUM Yuna
Courriel : [email protected] et [email protected]
Structure : Université de Nantes et de Rennes
Contingent dynamics in unbounded chemical networks : towards the emergence of prebiotic Darwinian processes
Origine et évolution des processus cellulaires impliqués dans la mort cellulaire programmée chez les métazoaires
Genome data mining pour la reconstruction des voies métaboliques et l'identification ciblées des gènes du système endocrinien chez un crustacé modèle en écotoxicologie, Gammarus fossarum
Application de modèles d'apprentissage automatique supervisés (supervised machine learning, SML) à des données provenant d'ADN environnemental pour identifier l'impact des stations d'épuration sur la biodiversité des cours d'eau intermittents
Reconstruction d'un génome foetal à partir d'un prélèvement de sang maternel
Contact : BARDEL Claire et CHATRON Nicolas
Courriel : [email protected] ; [email protected]
Structure : HCL
Etude des bases génomiques de l'évolution de la formule vertébrale des tétrapodes
Contact : HEUDE Eglantine et NECSULEA Anamaria
Courriel : [email protected] ; [email protected]
Structure : ENS et LBBE Lyon
Contribution des virus d'hymenoptères parasitoïdes aux transferts horizontaux
Contact : VARALDI Julien et GILBERT Clément
Courriel : [email protected] ; [email protected]
Structure : LBBE Lyon et EGCE Paris
Influence du régime alimentaire sur l'évolution du répertoire de gènes de dégradation de la lignocellulose
Contact : FRANCOIS Clémentine et LEFEBURE Tristan
Courriel : [email protected] et [email protected]
Structure : UCBLyon 1, LEHNA, UMR5023
Implementation and optimization of a workflow for the recontruction and denoising of tomograms from CryoEM data
Adaptation à un nouvel hôte (humain) chez la punaise de lit Cimex lectularius
Contact : VARALDI Julien et SEGUREL Laure
Courriel : [email protected] et [email protected]
Structure : LBBE Lyon
Diversité des gènes LILRB1 : création d'une base de séquences de référence, étude de la diversité génétique mondiale et implication fonctionnelle et médicale
Contact : DI CRISTOFARO Julie
Courriel : [email protected]
Structure : UMR7268 / Etab. français du sang PACA Corse
Annotation automatisée de peptides antimicrobiens d'insectes par des approches d'intelligence artificielle
Contact : PARISOT Nicolas et MONEGAT Carole
Courriel : [email protected] ; [email protected]
Structure : UMR INRAE/INSA Lyon
Apprentissage profond appliqué à la biophysique évolutive des protéines
Métabolisme et grandes transitions évolutives : étude du métabolisme du soufre et de son lien avec le métabolisme énergétique
Contact : GARCIA Pierre Simon
Courriel : [email protected]
Structure : Labo. de chimie bactérienne, Marseille
RESIST : rapid evolution of symbiotic interactions in response to stress : processes and mechanisms
Contact : KREMER Natacha et FABLET Marie
Courriel : [email protected] ; [email protected]
Structure : UCBLyon 1, LBBE (Villeurbanne)