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Dans le cadre du master Bioinfo@Lyon les étudiants sont amenés à réaliser deux stages. La durée des stages est de deux mois pour
le master 1 et de six mois pour le master 2. Ils permettent l'acquisition de 9 et 27 ECTs respectivement.
Les stages sont réalisés individuellement en entreprise ou au sein d'une structure de recherche privée ou publique.
Stages de M2 et de M1
DeepHornet : détection et caractérisation des attaques de frelons asiatiques aux abords immédiats des ruches
Contact : Frédéric Borne, Philippe Borianne, Laurence Gaume
Courriel : frederic.borne@cirad.fr, philippe.borianne@cirad.fr, lgaume@cirad.fr
Structure : UMR Botanique Modélisation de l'architecture des plantes et des végétations CIRAD Montpellier
Date de publication : 03/04/2019
Statut : M1 à pourvoir
Annotation de génomes de tiques
Contact :
Courriel : stage_rdbioseq@genoscope.cns.fr
Structure : Genoscope, Evry
Date de publication : 27/11/2019
Statut : M2 à pourvoir
Utilisation de longues lectures pour l'amélioration du catalogue de gènes du projet Tara Océans
Contact :
Courriel : stage_rdbioseq@genoscope.cns.fr
Structure : Genoscope, Evry
Date de publication : 27/11/2019
Statut : M2 à pourvoir
Séquençage nanopore et bioinformatique
Contact :
Courriel : stage_rdbioseq@genoscope.cns.fr
Structure : Genoscope, Evry
Date de publication : 27/11/2019
Statut : M2 à pourvoir
Comparaison de la biodiversité microbienne en lien avec laméthylation du mercure par une approche métagénomique
Contact : Cosio Claudia, Andrea Garcia Bravo
Courriel : claudia.cosio@univ-reims.fr, andrea.bravo@icm.csic.es
Structure : Departament de Biologia Marina i Oceanografia
Institut de Ciències del Mar, CSIC, Barcelona, Catalunya
Date de publication : 27/11/2019
Statut : M2 à pourvoir
Développement de méthodes de retraitement des données de spectrométrie de masse, appliquées à la caractérisation d’antigènes vaccinaux
Contact :
Courriel : https://sanofi.wd3.myworkdayjobs.com/StudentPrograms/job/Marcy-lEtoile/UN-STAGIAIRE---CHARGE-DE-BIOINFORMATIQUE-EN-LABORATOIRE--H-F-_R2524851
Structure : SANOFI PASTEUR, Marcy l'Etoile
Date de publication : 27/11/2019
Statut : M2 à pourvoir
Analyse métagénomique comparative par séquençage de gènes ADNr 16S pour caractériser le microbiote intestinal
Contact : Alban Caporossi, Alexandre Moreau-Gaudry
Courriel : acaporossi@chu-grenoble.fr,
amoreau-gaudry@chu-grenoble.fr
Structure : Centre d’Investigation Clinique - Innovation Technologique, CHU Grenoble Alpes, La Tronche
Date de publication : 27/11/2019
Statut : M2 à pourvoir
Analyses bioinformatiques des données de séquençage "long reads" pour la méta-génomique/transcriptomique du microbiome salivaire canin
Contact : Frédérique Hubler, Thomas Derrien, Sébastien Leuillet
Courriel : fhubler@univ-rennes1.fr, tderrien@univ-rennes1.fr, sebastien.leuillet@mxns.com
Structure : IGDR (Institut de Génétique et de Développement de Rennes), UMR6290 Université de Rennes, CNRS, Rennes
Date de publication : 27/11/2019
Statut : M2 à pourvoir
Assemblage hybride long/short reads, carte optique de quatre génomes du puceron du melon et du cotonnier Aphis gossypii. Annotations automatiques structurelle et fonctionnelle
Contact : Nathalie Boissot, Jacques Lagnel
Courriel : nathalie.boissot@inra.fr, jacques.lagnel@inra.fr
Structure : INRA/GAFL - Avignon
Equipe Résistance Diversité et Durabilité
Date de publication : 27/11/2019
Statut : M2 à pourvoir
Dissecting the impact of natural genetic variation on chromatin conformation and gene regulation
Contact : Mirko Francesconi
Courriel : Mirko.francesconi@ens-lyon.fr
Structure : Quantitative regulatory genomics team, LBMC, ENS Lyon
Date de publication : 27/11/2019
Statut : M2 à pourvoir
Detection and characterization of novel Papillomaviridae sequences in DNAsamples
Contact : Massimo Tommasino, Alexis Robitaille
Courriel : tommasinom@iarc.fr, robitaillea@students.iarc.fr
Structure : Infections and Cancer Biology Group, Lyon
Date de publication : 27/11/2019
Statut : M2 à pourvoir
Etude transcriptomique de la dégradation des ARNm au cours de la réponse immunitaire
Contact : Emiliano Ricci
Courriel : emiliano.ricci@ens-lyon.f
Structure : Laboratoire de Biologie et de Modélisation de la Cellule (LBMC), Ecole Normale Supérieure de Lyon(Lyon-Gerland)
Date de publication : 27/11/2019
Statut : M1-M2 à pourvoir
Analysis of genome-scale somatic alterations in ovarian cancer
Contact : Claire Renard, Jiri Zavadil
Courriel : renardc@iarc.fr, zavadilj@iarc.fr
Structure : CIRC, groupe Mécanismes Moléculaires et Biomarqueurs Lyon
Date de publication : 27/11/2019
Statut : M1-M2 à pourvoir